Zesduizend jaar voordat Sora en Shiro zelfs maar een oogwenk waren in de geschiedenis van Disboard, verteerde oorlog het land, verscheurde de hemel, vernietigde sterren en dreigde zelfs het menselijk ras uit te roeien. Te midden van de chaos en vernietiging leidt een jonge man genaamd Riku de mensheid naar de toekomst waar zijn hart in gelooft. Op een dag, in de ruïnes van een elfenstad, ontmoet hij Schwi, een vrouwelijke verbannen 'Ex Machina'-androïde die hem vraagt haar te leren wat het betekent om een menselijk hart te hebben.